古老的赛罕乌拉是契丹族的故土和发祥地。保护区境内至今尚留有辽庆洲白塔、辽庆陵、金代边堡等文化遗迹，是人们了解辽代历史的生动教材。

　　该保护区是中国大兴安岭南部山地景观的缩影，还是东亚阔叶林向大兴安岭寒温带针叶林、草原向森林的双重过度带，也是华北植物区系向兴安植物区系的过度带，成为联系各大植物区系的纽带和桥梁，对研究各大植物区系相互影响，相互交流有重大意义。这里又是生态交错带，可以通过该区生物多样性变化来研究生物对全球气候变化的影响，保护区已成为中一加两国生物多样性保护和社区发展项目示范区。

　　科学考察证实，保护区里有6个植被类型，36个群系，有野生高等真菌52种，苔藓植物176种，其中10种为珍稀濒危种，地衣62种，其中4种为中国新记录种，野生维管束植物700种，其中具有国家级保护价值的植物9种。有鸟类151种，其中有大鸨、乌雕、鸿雁、鸳鸯四种世界受胁种和金雕、黑颧等29种国家级重点保护鸟类，系国际鸟类联盟确定的世界重要鸟区，野生哺乳动物37种，其中有马鹿、青羊、猞猁等3种国家二级保护哺乳动物。此外还有大量的两栖类、爬行类、藻类等野生动物植物资源。保护区内涵养水源植物丰富，涓涓细流汇成了乌兰坝河、海青河、灰通河等十条河流，年径流量近亿立方米，是西辽河上游重要的水源涵养地。

　　为了加强赛罕乌拉自然保护区的保护与管理，保护区境内设立了正沟、五坟沟和乌兰坝等三个核心区，总面积达24.104万亩，占保护区总面积的16.27％。另外，为了保护赛罕乌拉原有的自然状态，保护生物多样性资源，保护区内还设立了三个生态旅游区，建立了容纳２万余号标本的自然博物馆。

　　1997年11月27日，自治区环保局组织各有关方面专家召开将赛罕乌拉自然保护区晋升为自治区级的评审会议。专家们一致同意，赛罕乌拉晋升为自治区级自然保护区。1998年2月26日，内蒙古自治区人民政府下达《内蒙古自治区人民政府关于同意赛罕乌拉自然保护区升级为自治区级自然保护区的批复》。内蒙古赛罕乌拉自然保护区随之建立。此后，为了落实内蒙古自治区人民政府有关加强对保护区的管理和保护，普及生物知识和环境保护知识，开发有潜力的资源指示精神，保护区一方面加强保护区管理力度，一方面积极创造条件向国家级自然保护区迈进。

　　1999年11月16日，国家级自然保护区评审委员会的25位委员在北京审查了《赛罕乌拉建立国家级自然保护区申报书》、《赛罕乌拉自然保护区综合科学考察集》、《赛罕乌拉自然保护区规划》，以及自然保护区功能区划图、地貌水系图、景观生境类型图。经过讨论，评审委员一致认为，赛罕乌拉自然保护区是我国保护森林、草原、河流、湿地等多样的生态系统和珍稀濒危野生动植物为主的重要区域，也是西辽河上游水源涵养的重点自然保护区。保护区在自然生态系统的典型性以及科学研究等诸多方面，都具有很高的保护价值，达到了国家级自然保护区的规定标准。同时，保护区基础工作较好，符合晋级条件。最后以记名投票方式表决通过了将赛罕乌拉自然保护区晋升为国家级自然保护区。此后，由国家环节保总局呈请国务院批准。

　　2000年月4日，国务院办公厅发出国办发（2000）30号文件即《国务院办公厅关于发布新建国家级自然保护区的通知》。国务院对国家环保总局提出新建成的18处国家级自然保护区经过审定，批准予以公布。赛罕乌拉自然保护区被列为其中，从此赛罕乌拉自然保护区晋入国家级行列。